Overigens trad er toch nog vertraging in de oplevering van de tramlijn op, vanwege problemen met de beveiliging in de Piet Heintunnel. In die Piet Heintunnel was overigens al bij de bouw, midden jaren '90, rekening gehouden met de komst van een metro- of tramlijn en werden dus gelijk drie buizen gebouwd (één voor rail, twee voor het wegverkeer).
Bij grote evenementen, zoals Koningsdag, rijdt lijn 26 vaak enkel tussen IJburg en het Zeeburgereiland en kunnen passagiers daar overstappen op pendelbus 326 naar het Centraal Station. Dit is noodzakelijk door het ontbreken van een keermogelijkheid verder richting het Centraal Station: de PTA-lus (waar [[Lijn 25 Amsterdam, President Kennedylaan - Passenger Terminal Amsterdam (2006-2011)|lijn 25]] tot en met 31 december 2011 het eindpunt had) is alleen te berijden komende vanuit het Centrum en dus niet vanuit IJburg.
Op [[Dienstregeling concessie Stadsvervoer Amsterdam 2012|1 januari 2012]] werd de frequentie wederom verhoogd, omdat het aantal passagiers bleef stijgen. In de ochtendspits ging de lijn tot wel elke 4 minuten rijden. Vervolgens werd per [[Dienstregeling concessie Stadsvervoer Amsterdam 2015|14 december 2014]] de frequentie op de drukste avonden in de week verhoogd naar elke 7,5-minuut.