Op [[Dienstregeling concessie Rotterdam Stadsvervoer 2009|14 december 2008]] ging de eerste concessie [[Concessie Rotterdam stadsvervoer|Rotterdam Stadsvervoer]] van start, die na onderhandse gunning in handen bleef van de [[RET]]. In het lijnennet werden op genoemde datum forse wijzigingen aangebracht. Op licht gewijzigde vertrek- en aankomsttijden na, bleven de route en dienstregeling vrijwel ongewijzigd. Wel werd de dienstregeling in het weekeinde later opgestart, vanwege de geringere bezetting op de vroege ritten.
Met ingang van Op [[Wijzigingen Dienstregeling concessie Rotterdam stadsvervoer Stadsvervoer 2012|11 december 2011]] is lijn 46 ingekort tot werden flinke bezuinigingen doorgevoerd in het lijnennet van de halte [[Lijn 46 Rotterdam, Westblaak - Waalhaven (Noord)|WestblaakRET]]. Het traject tussen Crooswijk en de Westblaak verviel kwam vanwege de geringere bezetting geheel, maar in te vervallen en op het overgebleven traject tussen de Westblaak en de Waalhaven werd de frequentie teruggebracht naar 3x per uur op doordeweekse dagen en 2x per uur op zaterdag. In de avonduren en op zondag werd voortaan helemaal niet meer gereden. Naar Crooswijk kwam konden reizigers eventueel nog gebruik maken van [[Lijn 7 Rotterdam, Willemsplein - Woudestein|tramlijn 7]] als vervanging.
