Op [[ZWN Dienstregeling Rijn- en Bollenstreek 1998/1999|24 mei 1998]] werd de oude [[Lijn 239 Alphen a/d Rijn Station NS - Leiden Station NS|lijn 239]] vernummerd naar '''249'''. Ook ging deze nieuwe lijn voortaan ook buiten de spitsuren en op zaterdag overdag 1x/uur rijden, maar was dan bij het Rijnland Ziekenhuis gekoppeld aan [[Lijn 49 Voorschoten Station - Leiderdorp Rijnland Ziekenhuis|lijn 49 (Voorschoten - Leiderdorp)]]. In de ochtendspits reden enkele extra ritten tussen Woubrugge en Leiderdorp enerzijds en Woubrugge en Alphen a/d Rijn anderzijds. In combinatie met [[Lijn 149 Ter Aar Aardam - Leiden Centraal Station (1998)|lijn 149]] werd een scheve halfuursdienst gereden tussen Leiden en het Ridderhof in Alphen a/d Rijn.
Op [[Connexxion Dienstregeling Rijn- en Bollenstreek/Leiden 1999/2000|30 mei 1999]] ging de [[ZWN-Groep|ZWN]] op in het nieuw ontstane [[Connexxion]], tezamen met [[NZH]], [[Oostnet]] en [[Midnet]]. Op die datum werd de route gewijzigd, de bus begon voortaan in Alphen a/d Rijn en reed via de Woubrugseweg via Woubrugge en langs Hoogmade naar Leiderdorp en Leiden. Ook vervielen de ritten op zaterdag vanwege de geringe bezetting.