Op [[Connexxion Dienstregeling Noordwest 1999/2000|30 mei 1999]] was de fusie tot [[Connexxion]] een feit. Vanaf die datum verviel het trajectdeel Wormer - Purmerend op zondag en moesten doorgaande reizigers (met behoud van aansluiting in Wormer) altijd overstappen op een andere bus.
Met Bij de overgang invoering van de concessiesystematiek kwam de lijn in de concessies [[Concessie Zaanstreek (2002-2004)|Zaanstreek]] en [[Concessie Waterland (2002-2005)|Waterland]] terecht (beide per 1 januari 2002). Concessiegrens was de halte Keerlus Wormer Oost. [[Connexxion]] bleef de lijn exploiteren. Op [[Dienstregeling concessie Waterland 2006|11 december 2005]] ging de volgende concessie [[Concessie Waterland (2006-2011)|Waterland]] naar van start, die na de aanbesteding was gewonnen door [[Arriva Nederland|Arriva]] werd lijn 88 ingekort tot het traject . [[Lijn 88 Purmerend Tramplein - Wormerveer Station|Lijn 88]] werd ingekort tot het traject Purmerend - Wormerveeren viel voortaan geheel in de concessie [[Concessie Waterland (2006-2011)|Waterland]]. Hierdoor werd [[Arriva Nederland|Arriva]] de nieuwe vervoerder van de lijn.
