Al sinds 2009 wordt er gesproken over de verplaatsing van het busstation om de verkeersstromen binnen Zwolle te bevorderen. Zo wordt er onder meer gesproken over de verplaatsing van het busstation bovenop het dak van het treinstation.<ref>http://www.rtvoost.nl/nieuws/?nid=94287</ref> De meest voor de hand liggende oplossing is het verplaatsen van het busstation naar de zuidzijde. Hier is bij de verbouwing van het station rekening mee gehouden. Het busstation voor trein vervangend vervoer ligt al aan deze kant van het station. Het nieuwe busstation zal een eilandperron hebben met daaraan 23 haltes. Naar verwachting zal het nieuwe busstation september 2018 gereed zijn.
Sinds dienstregeling 2012 zijn de vertrekperrons van sommige lijnen verhuisd naar het andere busstation voor een betere doorstroming. Daarnaast staan er nu tijdens de spitsen ook verkeersregelaars bij de uitritten voor beide busstations voor een betere doorstroming van vertrekkende bussen.