De lijn reed aanvankelijk in combinatie met [[Lijn 51 Leiden Centraal Station - Haarlem NS|lijn 51]] een kwartierdienst op maandag t/m vrijdag overdag en een halfuurdienst 's avonds en zondag.
Vanaf [[Wijzigingen concessie Zuid-Holland Noord 2013|9 december 2012]] werd [[Lijn 51 Leiden Centraal Station - Haarlem NS|lijn 51]] geïntegreerd in '''lijn 50''', zodat de frequentie op maandag t/m zaterdag omhoog ging naar 4x/uur en 2x/uur 's avonds en zondag.