Op [[Dienstregeling concessie Oost-Brabant 2021|25 oktober 2021]] werd na de reconstructie van de Graafseweg in Nijmegen de halte Cavaljéweg aan de route toegevoegd. De haltes Dennenstraat, Graafseweg/Wolfskuilseweg en Rozenstraat werden verplaatst.
Tijdens de coronapandemie heeft lijn 99 lange tijd de vakantiedienstregeling gereden. Op [[Dienstregeling concessie Arnhem - Nijmegen 2022|12 december 2021]] werd de voormalige winterdienstregeling hersteld op de volgende punten na: de toegevoegde ritten in de ochtendspits van Grave naar Nijmegen kwamen te vervallen; de ritten tussen 13:00 en 15:00 van Nijmegen naar Grave kwamen te vervallen; de toegevoegde ritten tussen Nijmegen en Grave tot 22:00 op doordeweekse avonden kwamen te vervallen. Tijdens de coronapandemie heeft lijn 99 lange tijd de vakantiedienstregeling gereden.
