Bij het station ligt een bushalte waar meerdere lijnen halteren of hun eindpunt hebben.
=== Streekbus ===
'''[[Concessie Noord- en Zuidwest-Friesland]]'''
* [[Lijn 71 Harlingen Station - Leeuwarden NS/Busstation|71: Station Harlingen - Station Leeuwarden]]
* [[Lijn 75 Franeker Station - Harlingen Station|75: Station Harlingen - Station Franeker]]
* [[Lijn 97 Leeuwarden NS/Busstation - Afsluitdijk Kop Afsluitdijk|97: Kop Afsluitdijk - Harlingen - Franeker - Menaldum - Leeuwarden]]
* [[Lijn 99 Heerenveen Busstation - Harlingen Veerbootterminal|99: Harlingen Veerbootterminal - Station Harlingen - Station Heerenveen]]
=== Qliner ===
* [[Lijn 351 Heerenveen Busstation - Harlingen Veerbootterminal|351: Harlingen Veerbootterminal - Station Harlingen - Station Heerenveen]]