}}
Station '''Alphen aan den Rijn''' is in 1878 als '''Alfen-Oudshoorn''' geopend aan de spoorlijn Leiden - Woerden. In 1915 werd het aangesloten op de [[Haarlemmermeerspoorlijnen]] door de [[spoorlijn Uithoorn - Alphen aan den Rijn]]. In 1918 werd de huidige naam Alphen aan den Rijn geintroduceerd, toen de dorpjes Alphen en Oudshoorn tot één plaats en gemeente werden samengevoegd. In 1932 wordt het station nogmaals uitgebreid, door de opening van de spoorlijn naar Gouda, tegenwoordig bekend als de [[RijnGouweLijn]]. In 1936 wordt de spoorlijn naar [[Uithoorn]] gesloten en opgebroken. Vanaf 1950 is het station bereikbaar voor elektrische treinen, sinds 1956 zijn dieseltreinen verleden tijd in Alphen. In 2004 is spoor 4 voorzien van een laag perron, voor de inzet van [[A32]]-tramstellen. Voor die tijd werd het spoor gebruikt als wachtspoor voor de dagelijkse goederentreinen, deze rijden tegenwoordig 's avonds.
In Alphen aan den Rijn worden in de spitsuren de series [[Serie 18800|18800]] en [[Serie 19500|19500]] gecombineerd en gesplitst. Hierdoor heeft de serie 19500 een relatief lange stop op het station.
Tot 2010 wordt het stationsgebied opnieuw ingericht, en de spoorwegovergangen vervangen door een voet- en fietsgangerstunnel, een lang gekoesterde wens van de gemeente. Bij het station verschijnt een markante fietsenstalling van staal in de vorm van een appel, hierdoor wordt het project ook wel eens Appel aan den Rijn genoemd. Voor dit project is wel het historische stationsgebouw gesloopt en een rijtje oude panden.