Tot 2010 is het stationsgebied opnieuw ingericht, mede op verzoek van de gemeente, waarbij de overwegen zijn vervangen door een voetgangers- en fietserstunnel. Bij het station is een markante stalen fietsenstalling in de vorm van een appel verschenen. In de volksmond kreeg het project de naam Appel aan den Rijn. Voor dit project zijn het historische stationsgebouw en een rijtje oude panden gesloopt.
== Dienstregeling 2023 2025 ===== Richting Leiden Centraal ==={{PatTop |{{PatRij1 | .09 | 8900 | [[Leiden Centraal]] |2| [[Sprinter]] | [[NS]] | ma-do spitsvr tot 10:30 & 15:30-19:30}}{{PatRij1 PatRij4| .24 | {{s|6700}}/<br>{{s| 8800 }} | [[Leiden Centraal]] |2| [[Sprinter]] | [[NS]]| }}{{PatRij1 | .39 | 8900 | [[Leiden Centraal]] |2| [[Sprinter]] | [[NS]] | ma-do spitsvr tot 10:30 & 15:30-19:30}}{{PatRij1 PatRij4| .54 | {{s|6700}}/<br>{{s| 8800 }} | [[Leiden Centraal]] |2| [[Sprinter]] | [[NS]]| }}
}}
=== Richting Utrecht Centraal ==={{PatTop |{{PatRij1 | .09 | 8800 | [[Utrecht Centraal's-Hertogenbosch]] |1| [[Sprinter]] | [[NS]] | ma-do tot 19:00}}{{PatRij1| .09 | 6700 | [[Tiel]] |1| [[Sprinter]] | [[NS]] | ma-do na 19:00 + vr-zo}}{{PatRij1 | .24 | 8900 | [[Utrecht Centraal]] |1| [[Sprinter]] | [[NS]] | ma-vr tot 10:00 & 15:00-19:00}}{{PatRij1| .39 | 8800 | [['s-Hertogenbosch]] |1| [[Sprinter]] | [[NS]] | ma-do spitstot 19:00}}{{PatRij1 | .39 | 8800 6700 | [[Utrecht CentraalTiel]] |1| [[Sprinter]] | [[NS]] | ma-do na 19:00 + vr-zo}}{{PatRij1 | .54 | 8900 | [[Utrecht Centraal]] |1| [[Sprinter]] | [[NS]] | ma-do spitsvr tot 10:00 & 15:00-19:00}}
}}
=== Richting Gouda ===
{{PatTop |{{PatRij1 | .10 | 8600 | [[Gouda]] |3| [[Sprinter]] | [[NS]]| }}{{PatRij1 | .25 | 8700 | [[Gouda]] |3| [[Sprinter]] | [[NS]] | ma-vr tot 19:00 ma-vr}}{{PatRij1 | .40 | 8600 | [[Gouda]] |3| [[Sprinter]] | [[NS]]| }}{{PatRij1 | .55 | 8700 | [[Gouda]] |3| [[Sprinter]] | [[NS]] | ma-vr tot 19:00 ma-vr}}
}}
{{PatVoetnoot}}
{{HistBedienLink}}
|naam=Station
|plaats=Alphen aan den Rijn
|concessie=[[Concessie Zuid-Holland Noord (20132025-20242032)|Zuid-Holland Noord]]|vervoerders=[[ArrivaQbuzz]]
|vorm=Perronbusstation
|type=Statisch
}}
Het busstation op het stationsplein is op 26 augustus 2012 heropend, nadat het tijdelijk verplaatst was naar het voormalige parkeerterrein aan de Havenstraat. Op dit busstation hebben meerdere stoppen de volgende buslijnen van [[Arriva]] hun eindpunt:
{{LijnTabel|plaats=Alphen aan den Rijn|halte=Station Alphen aan den Rijn|type=Bus}}
|naam=Station/Aziëlaan
|plaats=Alphen aan den Rijn
|concessie=[[Concessie Zuid-Holland Noord (20132025-20242032)|Zuid-Holland Noord]]|vervoerders=[[ArrivaQbuzz]]
}}
Aan de achterkant van het station ligt nog een bushalte voor een tweetal stadslijnen.
{{LijnTabel|plaats=Alphen aan den Rijn|halte=Alphen aan den Rijn Station/Aziëlaan|type=Bus}}
[[Categorie:RijnGouweLijn]][[Categorie:Spoorlijn Gouda - Alphen aan den Rijn]][[Categorie:Spoorlijn Woerden - Leiden]][[Categorie:Spoorlijn Uithoorn - Alphen aan den Rijn]]