Station '''Alphen aan den Rijn''' is in 1878 als '''Alfen-Oudshoorn''' geopend aan de spoorlijn Leiden - Woerden. In 1915 werd het aangesloten op de [[Haarlemmermeerspoorlijnen]] door de [[spoorlijn Uithoorn - Alphen aan den Rijn]]. In 1918 werd de huidige naam Alphen aan den Rijn geïntroduceerd, toen de dorpen Alphen en Oudshoorn tot één plaats en gemeente werden samengevoegd. In 1932 wordt het station nogmaals uitgebreid, door de opening van de spoorlijn naar Gouda. In 1936 wordt de spoorlijn naar [[Uithoorn]] gesloten en opgebroken. Vanaf 1950 is het station bereikbaar voor elektrische treinen, sinds 1956 zijn dieseltreinen verleden tijd in Alphen. In 2004 is spoor 4 voorzien van een laag perron om de inzet van [[A32]]-tramstellen mogelijk te maken. Spoor 4 is in gebruik geweest als wachtplaats voor goederentreinen.
Tot 2010 is het stationsgebied opnieuw ingericht, mede op verzoek van de gemeente, waarbij de overwegen zijn vervangen door een voetgangers- en fietserstunnel. Bij het station is een markante stalen fietsenstalling in de vorm van een appel verschenen. In de volksmond kreeg het project de naam Appel aan den Rijn. Voor dit project zijn het historische stationsgebouw en een rijtje oude panden gesloopt.
Het busstation op het stationsplein is op 26 augustus 2012 heropend, nadat het tijdelijk verplaatst was naar het voormalige parkeerterrein aan de Havenstraat. Op dit busstation stoppen de volgende buslijnen:
{{LijnTabel|plaats=Alphen aan den Rijn|halte=Station Alphen aan den Rijn|type=Bus}}
Aan de achterkant van het station ligt nog een bushalte voor een tweetal stadslijnen.
{{LijnTabel|plaats=Alphen aan den Rijn|halte=Alphen aan den Rijn Station/Aziëlaan|type=Bus}}
[[Categorie:RijnGouweLijn]][[Categorie:Spoorlijn Gouda - Alphen aan den Rijn]][[Categorie:Spoorlijn Woerden - Leiden]][[Categorie:Spoorlijn Uithoorn - Alphen aan den Rijn]]